农业银行通过网银进行公对公转账操作流程：登录公司银行账户网银，选择对公转账，输入收款方开户银行名称（精确到支行），输入收款方开户名（公司名称），输入收款方银行账号，输入转账金额，确认转账，转账成功，打印电子回单，退出网银。

中国农业银行网上银行办理流程：

1、前往农行网点办理注册登记手续。填写《中国农业银行电子银行业务申请表（个人）》，签署《中国农业银行电子银行服务协议》，出示有效身份证件和需要注册的账户原始凭证（金穗借记卡、金穗准贷记卡、活期存折、活期一本通）。

2、获得个人网上银行证书参考号和授权码（简称两码）。证书可存放在IE浏览器或USB-KEY中，客户可根据需要选择使用。

3、登录我行首页，点击软件下载-智能检测安装程序。

4、点击证书下载，根据提示输入两码，完成证书安装。