沿印度河发源于青藏高原，流经喜马拉雅山与喀喇昆仑山两山脉之间，流向西南而贯穿喜马拉雅山，右岸交会喀布尔河，左岸汇流旁遮普地方之诸支流，经巴基斯坦而入阿拉伯海。印度河流域属于亚热带气候，具有明显的季风气候特点，但由于东北部高山山脉的影响，使气候通常介于干燥与半干燥、热带与亚热带之间。

印度河河流进入巴基斯坦境内后，在布恩吉附近与吉尔吉特河相汇，然后转向西南流，转向西南贯穿巴基斯坦全境，在卡拉奇附近注入阿拉伯海。左侧支流的上游部分大部分在印度境内，少部分在中国境内，右侧的一些支流源于阿富汗。

印度河平原的东部为塔尔沙漠的延伸部分，分成南北两部分，北部沙漠称为乔利斯坦沙漠，南部沙漠仍称塔尔沙漠，面积均约3.4万平方公里。印度河平原的西北抵俾路支高原的苏来曼山脉。印度河平原以北纬29‘为界，分为上印度河平原和下印度河平原。

上印度河平原为五河（萨特莱杰河、拉维河、杰纳布河、杰赫勒姆河、印度河）汇合之地，有宽阔的河间地，一般高出河床5-20米，河道蜿蜒。河床不断移动，洪水时带来的大量泥沙，经常堆积成新的冲积层和浅滩。