MarginNote3是一款知识管理工具，它可以让用户在文档中添加注释、摘录、标记、图表等，方便用户管理自己的笔记和知识。

MarginNote3提供了两个版本：免费版和付费版。下面是它们之间的区别：

1、功能：付费版相对免费版来说，提供了更多的功能。比如，付费版可以在PDF中添加和编辑标签和书签；可以在笔记中插入视频和音频；可以利用智能摘录功能快速摘录信息等。

2、备份：付费版支持云端备份，可以将笔记同步到iCloud或Dropbox中，确保用户的笔记不会丢失。

3、价格：免费版是免费的，而付费版需要一定的费用。目前（截至2023年3月），MarginNote3的价格为$34.99美元。

4、设备数量：付费版支持在多台设备上使用，而免费版只能在一台设备上使用。

5、导出格式：付费版支持将笔记导出为多种格式，如Markdown、Mindmap等，而免费版只支持PDF、EPUB和文本格式。

6、OCR功能：付费版可以使用OCR（光学字符识别）功能将PDF中的文字识别出来，方便用户搜索和编辑文本。免费版不支持OCR。

7、定制性：付费版可以定制主题、字体、界面布局等，而免费版不能。

如果用户只需要基本的注释和摘录功能，那么使用免费版就可以满足需求。但如果需要更多的高级功能和备份服务，那么付费版可能更适合。付费版的功能更加全面、灵活，而且支持多台设备和云端备份。如果用户需要更高级的功能和服务，付费版是更好的选择。