在堆粪场铺一层厚10cm-15cm的细草，以吸收下渗液体，然后将牛粪堆积成条垛状，表面拍实、抹平，再用泥或黑色塑料膜封好。1个月后，人工或用机械翻堆一次，再重新堆好。用同样的方法封严，达到完全腐熟。夏季约需2个月，冬季则需3至4个月。完全腐熟的标志是粪便不粘手、转化成质地均匀的黑褐色物质。

牛粪在堆粪场堆积发酵是经过一个60℃以上的高温过程，能杀死各种病菌和虫卵，粪污中的多种成分能转变成植物生长需要的有效养分，即成为有机肥料，可直接施于设施农业栽培或农作物种植。

随着养牛业的快速发展，粪便污染已成为一大难题，据有关资料显示，在一些地方，牛粪对环境的污染已超过了工业污染的总量，有的甚至高达2倍以上。一头奶牛每年产生的粪便在7吨以上，一头黄牛产生的粪便在5-6吨之间。

由于各地对牛粪的处理普遍重视不够，一些养牛比较集中的地方，基本上都没有牛粪处理设施。这样导致牛粪到处乱堆乱放，尤其在南方，每到夏季，臭气冲天，既对周边居民的正常生活造成不良影响，同时牛粪又是多种细菌病原体孳生繁殖的源头，对养殖群体有着严重的影响。