1、种植抗病或耐病品种。

2、药剂防治。用40%的菌核净可湿性粉剂，使用浓度400-500倍(每亩用药液50-60kg，根据烟株大小喷施药液，一般喷施均匀周到，如遇雨要补喷，其药效能稳定在75%以上，是目前防治赤星病比较好的药剂。10%宝丽安可湿性粉剂，一般用600至800倍(每亩用药液60kg)，其防治效果与菌核净效果相似，亦可达70%以上。

3、改进栽培措施，适时早栽；合理密度；合理施肥；搞好田间卫生，以减少侵染源；实行轮作。赤轮作减少了土壤中含菌量，可减轻赤星病危害。

烟草赤星病于1892年由Ellis和Everhart在美国作了首次报道，但20世纪50年代中期之前，在美国一直是次要病害。1956年在北卡罗来纳州突然暴发流行，以后在美国各烟区转变为毁灭性的病害。烟草赤星病在世界各国均有发生，1931年在津巴布韦广泛传播。

1940年代以前在非洲已经是为害烟草的严重病害；1963年在日本严重发生；1994年前南斯拉夫报道在Serbia地区的香料烟上是新病害。此外，该病在哥伦比亚、阿根廷、委内瑞拉、澳大利亚、加拿大等国对烟叶生产构成威胁。