在革兰氏染色中，蓝色是由于在细菌表面覆盖了一层蓝色的细菌外膜所形成的。这种蓝色的细菌外膜通常由革兰氏阳性菌（G+菌）产生，而革兰氏阴性菌（G-菌）则不会产生这种蓝色的细菌外膜。

在革兰氏染色中，如果将细菌涂成革兰氏阳性菌（G+菌），细菌表面会形成一层蓝色的细菌外膜，而如果将细菌涂成革兰氏阴性菌（G-菌），细菌表面会形成一层红色的细菌外膜。因此，革兰氏染色中的蓝色通常是指革兰氏阳性菌的细菌外膜所形成的颜色。

革兰氏染色（Gram Staining）是用来鉴别细菌的一种方法：这种染色法利用细菌细胞壁上的生物化学性质不同，可将细菌分成两类，即革兰氏阳性（Gram Positive）与革兰氏阴性（Gram Negative）。这一染色方法由丹麦医生汉斯·克里斯蒂安·革兰于1884年所发明，最初是用来鉴别肺炎球菌与克雷白氏肺炎菌之间的关系，后推广为鉴别细菌种类的重要特性之一，对由细菌感染引起的疾病的临床诊断及治疗有着广泛用途。