阿拉尔市与吉尔吉斯斯坦、塔吉克斯坦和哈萨克斯坦共和国接壤。阿拉尔，是新疆维吾尔自治区直辖县级市，与新疆生产建设兵团第一师实行师市合一管理体制，由新疆生产建设兵团管理。

阿拉尔市位于新疆阿克苏地区境内，北起天山南麓山地，南至塔克拉玛干沙漠北缘，东临沙雅县，西抵柯坪县，傍依阿克苏河、塔里木河、台兰河、多浪河水系。地跨阿克苏地区5县1市（温宿县、乌什县、阿瓦提县、柯坪县、沙雅县、阿克苏市），东西相距281千米，南北相距180千米，阿拉尔市面积6923.4平方千米。地理位置介于东经80°30′至81°58′，北纬40°22′至40°57′之间。

阿拉尔市属暖温带极端大陆性干旱荒漠气候，极端最高气温35℃（沙井子垦区每隔5-10年遇最高温40℃），极端最低气温-28℃（四团垦区最低气温为-33.2℃）。垦区太阳辐射年均133.7-146.3千卡/平方厘米。

阿拉尔市境内野生木本植物有：胡杨、灰杨、红柳、灌木柳、白刺、云杉、桦木、苦杨、山柳等。野生草本植物有：芦苇、罗布麻、香蒲、水草、毛蜡、骆驼刺、碱蓬、黄麻、马兰、酥油草和水生蒲、菹、浮等40余科、140余种。